Панель "Наследственная тугоухость"

Метод исследования: секвенирование нового поколения (NGS).

Более 50% всех случаев врожденной и ранней детской тугоухости связаны с мутациями генов. Считается, что каждый восьмой человек является носителем одного из генов, вызывающих рецессивную тугоухость. Панель "Наследственная тугоухость" включает анализ 146 генов связанных с нарушениями слуха, которые возникают под действием генетических факторов, в том числе в результате гомозиготных мутаций, унаследованных от родителей. Различают несиндромальную (снижение слуха не сопровождается другими признаками или заболеваниями других органов и систем) и синдромальную (сопровождается заболеваниями других органов и систем) тугоухость. Синдромальная патология составляет 20-30%, несиндромальная до 70-80%.

Для наследственной тугоухости характерен рецессивный тип наследования. Ребенок получает от каждого из родителей один патологический вариант гена, который вызывает данную форму нарушения слуха. Рецессивный ген проявляется лишь в паре с другим таким же геном. При этом родители ребенка не страдают нарушением слуха, так как они имеют один нормальный вариант данного гена в паре генов, полученных от своих родителей. Но они являются носителями гена рецессивной несиндромальной глухоты. Таким образом, у ребенка может быть нарушение слуха, а его родители и все другие родственники имеют нормальный слух. Самым значимым для развития тугоухости оказался ген коннексина 26. Его мутация 35delG, отвечает за 40% всех случаев врожденной детской тугоухости. Заболевание проявляется только в случае встречи двух измененных генов в генотипе человека. Если носитель мутации гена рецессивной тугоухости вступит в брак с лицом, не являющимся носителем патологически измененного гена, у них не будет детей с нарушением слуха, но каждый второй ребенок может оказаться носителем измененного варианта гена. Так ген будет передаваться не проявляя себя, пока не встретит себе пару. Таким образом, если ребенку поставили диагноз наследственной тугоухости, это не значит, что всем его потомкам угрожает нарушение слуха.

Виды генетических изменений, определяемых панелью «Наследственная тугоухость»:

• Однонуклеотидные  и мультинуклеотидные варианты (SNV и MNV) в экзонах всех клинически значимых генов;
• Малые вставки-делеции (in/del) до 50 пар нуклеотидов в экзонах всех клинически значимых генов;
• Вариации числа копий генов (CNV), такие как делеции/микроделеции и дупликации/микродупликации среднего и крупного размера (с ограничениями);

Показания к исследованию: нарушения слуха, выявленные в любом возрасте.

Список генов, входящих в исследование:

ABHD12, ACTB, ACTG1, ALMS1, ANKH, ATP2B2, ATP6V1B1, BCS1L, BSND, CACNA1D, CCDC103, CCDC39, CCDC40, CCDC50, CD151, CDH23, CDKN1C, CEACAM16, CHD7, CHSY1, CIB2, CLDN14, CLRN1, COCH, COL11A1, COL11A2, COL2A1, COL4A3, COL4A4, COL4A5, COL4A6, COL9A1, COL9A2, COL9A3, CRYM, DFNA5, DFNB31, DFNB59, DIABLO, DIAPH1, DIAPH3, DLX5, DNAAF1, DNAAF2, DNAAF3, DNAH11, DNAH5, DNAI1, DNAI2, DNAL1, DSPP, EDN3, EDNRB, ESPN, ESRRB, EYA1, EYA4, FGF3, FOXI1, GATA3, GIPC3, GJB1, GJB2, GJB3, GJB4, GJB6, GPSM2, GRHL2, GRXCR1, HGF, HYDIN, ILDR1, JAG1, KARS, KCNE1, KCNJ10, KCNQ1, KCNQ4, LARS2, LHFPL5, LHX3, LOXHD1, LRRC6, LRTOMT, MANBA, MARVELD2, MIR96, MITF, MSRB3, MTAP, MYH14, MYH9, MYO15A, MYO3A, MYO6, MYO7A, NDP, NLRP3, NME8, NR2F1, OTOA, OTOF, PAX3, PCDH15, PDZD7, PMP22, POLR1C, POLR1D, POU3F4, POU4F3, PRPS1, PTPRQ, RDX, RSPH4A, RSPH9, SEMA3E, SERPINB6, SIX1, SIX5, SLC12A1, SLC17A8, SLC19A2, SLC26A4, SLC26A5, SMPX, SNAI2, SOX10, SOX2, SPINK5, STRC, TCOF1, TECTA, TFAP2A, TIMM8A, TJP2, TMC1, TMIE, TMPRSS3, TNC, TPRN, TRIOBP, TYR, USH1C, USH1G, USH2A, WFS1

При секвенировании генов, включенных в панель "Наследственная тугоухость" , вероятность обнаружения причины заболевания составляет 20-45%.

Ограничения метода:

• не выявляет генетические варианты в повторяющихся вариантах генома (гены, имеющие псевдогены, паралоги, сегментарные повторы);
• точность метода снижена в сложных участках генома (GC богатые и poly-n участки).