Исследование состава микробиоты толстого кишечника у детей в возрасте 0-14 лет ЭНТЕРОФЛОР, (количеств.)

Метод исследования: ПЦР в режиме реального времени

Исследование предназначено для исследования состава микробиоты толстого кишечника у детей 0-14 лет.

Стандартным методом исследования состава микробиоты человека является культуральный метод. Однако 50-80% микроорганизмов, составляющих кишечную микробиоту, являются труднокультивируемыми и не выявляются микробиологическим методом, кроме того, результаты посева напрямую зависят от сохранения жизнеспособности микроорганизмов. Посев кала на дисбактериоз предполагает выявление определенного спектра бактерий и грибов в отличие от стандартного посева, при котором происходит культивирование широкого перечня микроорганизмов на различных питательных средах.

Данное исследование позволяет выявить общее количество бактерий, оценить долю нормофлоры, метаболически активных видов  бифидобактерий – основных представителей нормофлоры кишечника, а также долю метаболически активных «детских» видов и их разнообразие, также количественно оценить ДНК лактобактерий, бактероидов, дрожжевых грибов.  Наряду с оценкой нормофлоры проводится качественное определение ДНК кишечно-ассоциированных микроорганизмов (Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria, Fusobacteria, Verrucomicrobia, Euryarchaeota), в том числе грибов рода Candida, а также гена метициллинрезистентности Staphylococcus spp. (mecA), Cl.difficile с генами энтеротоксинов А и В (tcdA, tcdB), Str.agalactiae с геном инвазивности (srr2).



Динамика формирования кишечной микробиоты у детей зависит от срока гестации, способа родоразрешения, типа питания и применения антибиотиков, поэтому состав микробиоты может различаться у детей одного возраста.

Кишечная микробиота младенцев, рожденных естественным путем, характеризуется низким разнообразием, но стабильным составом, так как при родах дети контактируют с представителями вагинальной, кожной и фекальной микробиоты матери. У детей, рожденных путем кесарева сечения, формирование кишечной микробиоты происходит дольше и чаще обнаруживаются условно-патогенные микроорганизмы (УПМ), такие как Clostridium difficile, Enterococcus spp., Klebsiella spp., Streptococcus spp. и Veillonella spp.

При грудном вскармливании микробиота кишечника представлена в основном Bifidobacterium spp. (в частности Bifidobacterium breve, Bifidobacterium bifidum и Bifidobacterium longum), а также Lactobacillus spp., Streptococcus spp., Enterococcus spp. и Lactococcus spp. [9]. У детей, находящихся на искусственном вскармливании, в микробиоте преобладают анаэробы — представители родов Bacteroides и Clostridium, и снижено число бифидобактерий [10-11].

Гестационный возраст является еще одним ключевым фактором, влияющим на формирование микробиоты кишечника. У недоношенных детей развитие пищеварительной и иммунной систем не завершено. Госпитализация, искусственное вскармливание, применение антибиотиков могут привести к необратимым изменениям в естественном процессе  колонизации и развития микробиоты кишечника. В частности, у недоношенных новорожденных задерживается анаэробная колонизация, и их фекалии содержат большие количества Enterobacteriaceae, Enterococcus и условно-патогенной микрофлоры  по сравнению с доношенными новорожденными.

Нормальная микробиота представлена широким спектром микроорганизмов, которые в основном являются представителями трех филумов: Actinobacteria, Firmicutes и Bacteroidetes. Филум Actinobacteria в кишечной микробиоте детей представлен родом Bifidobacterium.

Большая часть кишечных микроорганизмов филума Firmicutes относится к классу Clostridia. Это наиболее представленный таксон в кишечнике человека, участники которого могут входить как в нормальную микробиоту, так и относиться к условно-патогенной или даже патогенной микробиоте.

Клостридии нормобиоты расщепляют белки и жиры, поставляя пищевые субстраты другим микроорганизмам. Клостридии  являются поставщиком источника энергии для эпителиоцитов толстой кишки. Внутри рода Clostridium наиболее представлены в нормобиоте кишечника Clostridium leptum gr. и Lachnospiraceae (Clostridium coccoides gr), составляющие до 40% и 35% соответственно от общего количества бактерий.

Филум Bacteroidetes является вторым по объему в кишечной микробиоте. Представители филума Bacteroidetes играют важную роль в метаболизме полисахаридов, являются основными производителями противовоспалительных жирных кислот в кишечнике и секретируют  метаболиты, участвующие в регуляции работы иммунной и нервной систем.

Показания к исследованию:

• длительно протекающие кишечные расстройства, при которых не удается выделить патогенные микроорганизмы;
• дисфункция кишечника у детей при интенсивной антибиотико- и/или иммуносупрессивной терапии, длительной химиотерапии, гормональной терапии;
• затянувшийся период восстановления после дизентерии и других острых кишечных инфекционных заболеваний;
• наличие бактериемии, гнойно-воспалительных очагов, трудно поддающихся лечению;
• предоперационный период у лиц с факторами риска развития дисбактериоза кишечника;
• аллергические заболевания (атопический дерматит, бронхиальная астма и пр.), трудно поддающиеся лечению;
• внутриутробная инфекция;
• раннее искусственное вскармливание;
• непереносимость грудного молока;
• иммунодефицитные состояния;
• частые острые респираторные инфекции;
• задержка нарастания или снижение массы тела, отставание в физическом развитии;
• стоматит, молочница;
• контроль формирования кишечной микробиоты у детей первого года жизни.

Преимущества исследования ЭНТЕРОФЛОР Дети:
 

• Создан на основе современных фундаментальных представлений о микробиоме человека.
• Количественное определение более 40 показателей, отражающих до 99,9% возможных таксонов микробиоты кишечника детей от 0 до 14 лет.
• Заключение формируется с учётом возрастных норм состава микробиоты кишечника детей.

На основании полученных результатов программа автоматически рассчитывает долю нормальной микрофлоры в процентах, общее количество бифидобактерий в Lg (ГЭ/г), оценивает таксономическое разнообразие нормальной микрофлоры, наличие и долю метаболически активных видов бифидобактерий, долю условно-патогенных микроорганизмов и наличие дрожжеподобных грибов.