Исследование состава микробиоты толстого кишечника у детей в возрасте 0-14 лет ЭНТЕРОФЛОР, (количеств.)
Метод исследования: ПЦР в режиме реального времени
Исследование предназначено для исследования состава микробиоты толстого кишечника у детей 0-14 лет.
Стандартным методом исследования состава микробиоты человека является культуральный метод. Однако 50-80% микроорганизмов, составляющих кишечную микробиоту, являются труднокультивируемыми и не выявляются микробиологическим методом, кроме того, результаты посева напрямую зависят от сохранения жизнеспособности микроорганизмов. Посев кала на дисбактериоз предполагает выявление определенного спектра бактерий и грибов в отличие от стандартного посева, при котором происходит культивирование широкого перечня микроорганизмов на различных питательных средах.
Данное исследование позволяет выявить общее количество бактерий, оценить долю нормофлоры, метаболически активных видов бифидобактерий – основных представителей нормофлоры кишечника, а также долю метаболически активных «детских» видов и их разнообразие, также количественно оценить ДНК лактобактерий, бактероидов, дрожжевых грибов. Наряду с оценкой нормофлоры проводится качественное определение ДНК кишечно-ассоциированных микроорганизмов (Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria, Fusobacteria, Verrucomicrobia, Euryarchaeota), в том числе грибов рода Candida, а также гена метициллинрезистентности Staphylococcus spp. (mecA), Cl.difficile с генами энтеротоксинов А и В (tcdA, tcdB), Str.agalactiae с геном инвазивности (srr2).
Динамика формирования кишечной микробиоты у детей зависит от срока гестации, способа родоразрешения, типа питания и применения антибиотиков, поэтому состав микробиоты может различаться у детей одного возраста.
Кишечная микробиота младенцев, рожденных естественным путем, характеризуется низким разнообразием, но стабильным составом, так как при родах дети контактируют с представителями вагинальной, кожной и фекальной микробиоты матери. У детей, рожденных путем кесарева сечения, формирование кишечной микробиоты происходит дольше и чаще обнаруживаются условно-патогенные микроорганизмы (УПМ), такие как Clostridium difficile, Enterococcus spp., Klebsiella spp., Streptococcus spp. и Veillonella spp.
При грудном вскармливании микробиота кишечника представлена в основном Bifidobacterium spp. (в частности Bifidobacterium breve, Bifidobacterium bifidum и Bifidobacterium longum), а также Lactobacillus spp., Streptococcus spp., Enterococcus spp. и Lactococcus spp. [9]. У детей, находящихся на искусственном вскармливании, в микробиоте преобладают анаэробы — представители родов Bacteroides и Clostridium, и снижено число бифидобактерий [10-11].
Гестационный возраст является еще одним ключевым фактором, влияющим на формирование микробиоты кишечника. У недоношенных детей развитие пищеварительной и иммунной систем не завершено. Госпитализация, искусственное вскармливание, применение антибиотиков могут привести к необратимым изменениям в естественном процессе колонизации и развития микробиоты кишечника. В частности, у недоношенных новорожденных задерживается анаэробная колонизация, и их фекалии содержат большие количества Enterobacteriaceae, Enterococcus и условно-патогенной микрофлоры по сравнению с доношенными новорожденными.
Нормальная микробиота представлена широким спектром микроорганизмов, которые в основном являются представителями трех филумов: Actinobacteria, Firmicutes и Bacteroidetes. Филум Actinobacteria в кишечной микробиоте детей представлен родом Bifidobacterium.
Большая часть кишечных микроорганизмов филума Firmicutes относится к классу Clostridia. Это наиболее представленный таксон в кишечнике человека, участники которого могут входить как в нормальную микробиоту, так и относиться к условно-патогенной или даже патогенной микробиоте.
Клостридии нормобиоты расщепляют белки и жиры, поставляя пищевые субстраты другим микроорганизмам. Клостридии являются поставщиком источника энергии для эпителиоцитов толстой кишки. Внутри рода Clostridium наиболее представлены в нормобиоте кишечника Clostridium leptum gr. и Lachnospiraceae (Clostridium coccoides gr), составляющие до 40% и 35% соответственно от общего количества бактерий.
Филум Bacteroidetes является вторым по объему в кишечной микробиоте. Представители филума Bacteroidetes играют важную роль в метаболизме полисахаридов, являются основными производителями противовоспалительных жирных кислот в кишечнике и секретируют метаболиты, участвующие в регуляции работы иммунной и нервной систем.
Показания к исследованию:
Исследование предназначено для исследования состава микробиоты толстого кишечника у детей 0-14 лет.
Стандартным методом исследования состава микробиоты человека является культуральный метод. Однако 50-80% микроорганизмов, составляющих кишечную микробиоту, являются труднокультивируемыми и не выявляются микробиологическим методом, кроме того, результаты посева напрямую зависят от сохранения жизнеспособности микроорганизмов. Посев кала на дисбактериоз предполагает выявление определенного спектра бактерий и грибов в отличие от стандартного посева, при котором происходит культивирование широкого перечня микроорганизмов на различных питательных средах.
Данное исследование позволяет выявить общее количество бактерий, оценить долю нормофлоры, метаболически активных видов бифидобактерий – основных представителей нормофлоры кишечника, а также долю метаболически активных «детских» видов и их разнообразие, также количественно оценить ДНК лактобактерий, бактероидов, дрожжевых грибов. Наряду с оценкой нормофлоры проводится качественное определение ДНК кишечно-ассоциированных микроорганизмов (Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria, Fusobacteria, Verrucomicrobia, Euryarchaeota), в том числе грибов рода Candida, а также гена метициллинрезистентности Staphylococcus spp. (mecA), Cl.difficile с генами энтеротоксинов А и В (tcdA, tcdB), Str.agalactiae с геном инвазивности (srr2).
Динамика формирования кишечной микробиоты у детей зависит от срока гестации, способа родоразрешения, типа питания и применения антибиотиков, поэтому состав микробиоты может различаться у детей одного возраста.
Кишечная микробиота младенцев, рожденных естественным путем, характеризуется низким разнообразием, но стабильным составом, так как при родах дети контактируют с представителями вагинальной, кожной и фекальной микробиоты матери. У детей, рожденных путем кесарева сечения, формирование кишечной микробиоты происходит дольше и чаще обнаруживаются условно-патогенные микроорганизмы (УПМ), такие как Clostridium difficile, Enterococcus spp., Klebsiella spp., Streptococcus spp. и Veillonella spp.
При грудном вскармливании микробиота кишечника представлена в основном Bifidobacterium spp. (в частности Bifidobacterium breve, Bifidobacterium bifidum и Bifidobacterium longum), а также Lactobacillus spp., Streptococcus spp., Enterococcus spp. и Lactococcus spp. [9]. У детей, находящихся на искусственном вскармливании, в микробиоте преобладают анаэробы — представители родов Bacteroides и Clostridium, и снижено число бифидобактерий [10-11].
Гестационный возраст является еще одним ключевым фактором, влияющим на формирование микробиоты кишечника. У недоношенных детей развитие пищеварительной и иммунной систем не завершено. Госпитализация, искусственное вскармливание, применение антибиотиков могут привести к необратимым изменениям в естественном процессе колонизации и развития микробиоты кишечника. В частности, у недоношенных новорожденных задерживается анаэробная колонизация, и их фекалии содержат большие количества Enterobacteriaceae, Enterococcus и условно-патогенной микрофлоры по сравнению с доношенными новорожденными.
Нормальная микробиота представлена широким спектром микроорганизмов, которые в основном являются представителями трех филумов: Actinobacteria, Firmicutes и Bacteroidetes. Филум Actinobacteria в кишечной микробиоте детей представлен родом Bifidobacterium.
Большая часть кишечных микроорганизмов филума Firmicutes относится к классу Clostridia. Это наиболее представленный таксон в кишечнике человека, участники которого могут входить как в нормальную микробиоту, так и относиться к условно-патогенной или даже патогенной микробиоте.
Клостридии нормобиоты расщепляют белки и жиры, поставляя пищевые субстраты другим микроорганизмам. Клостридии являются поставщиком источника энергии для эпителиоцитов толстой кишки. Внутри рода Clostridium наиболее представлены в нормобиоте кишечника Clostridium leptum gr. и Lachnospiraceae (Clostridium coccoides gr), составляющие до 40% и 35% соответственно от общего количества бактерий.
Филум Bacteroidetes является вторым по объему в кишечной микробиоте. Представители филума Bacteroidetes играют важную роль в метаболизме полисахаридов, являются основными производителями противовоспалительных жирных кислот в кишечнике и секретируют метаболиты, участвующие в регуляции работы иммунной и нервной систем.
Показания к исследованию:
- длительно протекающие кишечные расстройства, при которых не удается выделить патогенные микроорганизмы;
- дисфункция кишечника у детей при интенсивной антибиотико- и/или иммуносупрессивной терапии, длительной химиотерапии, гормональной терапии;
- затянувшийся период восстановления после дизентерии и других острых кишечных инфекционных заболеваний;
- наличие бактериемии, гнойно-воспалительных очагов, трудно поддающихся лечению;
- предоперационный период у лиц с факторами риска развития дисбактериоза кишечника;
- аллергические заболевания (атопический дерматит, бронхиальная астма и пр.), трудно поддающиеся лечению;
- внутриутробная инфекция;
- раннее искусственное вскармливание;
- непереносимость грудного молока;
- иммунодефицитные состояния;
- частые острые респираторные инфекции;
- задержка нарастания или снижение массы тела, отставание в физическом развитии;
- стоматит, молочница;
- контроль формирования кишечной микробиоты у детей первого года жизни.
- Создан на основе современных фундаментальных представлений о микробиоме человека.
- Количественное определение более 40 показателей, отражающих до 99,9% возможных таксонов микробиоты кишечника детей от 0 до 14 лет.
- Заключение формируется с учётом возрастных норм состава микробиоты кишечника детей.
Специальная подготовка к исследованию не требуется. Исследование рекомендовано проводить не ранее чем через два дня после окончания приёма энтеросорбентов, про- и пребиотиков. Кал или меконий собрать в контейнер в количестве одной мерной ложки, плотно закрыть и хранить при комнатной температуре (от 18 °С до 25 °С) не более 6 часов.
Единицы измерения: lg (ГЭ/г), %
Срок выполнения с момента поступления в лабораторию:
2-5 дней
Тип биоматериала
порция кала, у новорожденных меконий
Цена услуги
5100 руб
Процедура взятия биоматериала оплачивается отдельно и зависит от типа материала:
Взятие крови из периферической вены
130 руб
Взятие биоматериала в процедурном кабинете (отделяемое мочеполовых органов)
210 руб
Взятие биоматериала в процедурном кабинете (отделяемое уха, глаза, верхних дыхательных путей)
110 руб
Взятие биоматериала на коронавирус (соскоб из ротоглотки, соскоб из носоглотки)
160 руб