Исследование микробиоты (биотоп "Влагалище") (ГХ-МС по Осипову)

Метод исследования: ГХ-МС.

Микробиом человеческого кишечника представляет собой уникальную совокупность микроорганизмов. Его незримое присутствие регулирует целый ряд важных процессов - от метаболических и иммунных до когнитивных, а отклонение его состава от нормы приводит к развитию разнообразных патологических состояний: желудочно-кишечных, аллергических и аутоиммунных заболеваний, сахарного диабета, ожирения и т.п.

В настоящее время понятие «микрофлора человека» утратило свою актуальность: мы несем в своем организме не просто набор бактерий, а настоящий биом - микробиом. Наше тело - это место обитания многочисленной популяции микроорганизмов, своего рода микробная экосистема, характеризующаяся своей генетической регуляцией и сложными взаимодействиями и реагирующая на влияние факторов внешней и внутренней среды. Она настолько уникальна, что в мире не найдется двух людей с идентичным микробиомом.

Микробиом распределен в нашем организме неравномерно, по его топографии и видовому составу принято различать микробиом кожи, полости рта, дыхательных путей, урогенитального тракта и кишечника.

Микрофлору влагалища принято подразделять на облигатную и факультативную. Облигатные микроорганизмы играют значительную роль в защите репродуктивной системы от возбудителей инфекционных заболеваний и постоянно присутствуют во влагалище здоровой женщины. Факультативные микроорганизмы встречаются достаточно часто, но не постоянно. К транзиторной флоре, привнесенной извне, относятся непатогенные, условно-патогенные микроорганизмы и облигатные патогены. Лактобактерии преобладают у 96% здоровых женщин и являются основными представителями облигатной микрофлоры, выполняют защитную функцию. Лактобактерии адгезированы на эпителиоцитах влагалища, являются неотъемлемой частью экологического барьера, блокируя рецепторы клеток болезнетворных микроорганизмов. В настоящее время воспалительные заболевания половых органов относят к смешанным полимикробным инфекциям, важнейшими возбудителями которых, по данным ВОЗ, являются анаэробно-аэробные ассоциации (25–60%), N. gonorrhoeae (25–40%), C. trachomatis (25–30%), Mycoplasma spp. (до 45%). По мнению ряда авторов, острые воспалительные заболевания придатков матки сопровождаются выраженным дисбиозом генитального тракта и часто протекают бессимптомно.

В условиях современного социума прослеживается тенденция к изменению этиологической структуры инфекционных заболеваний урогненитальной зоны, а именно, снижение удельного веса инфекций, вызываемых традиционными патогенами, и возрастающая роль условно-патогенных микроорганизмов, учащение случаев обострения клинических признаков, сочетание легкого клинического течения с поражением восходящих отделов мочеполового тракта, случаев осложненного течения, возросла частота смешанных инфекций, когда этиологическую роль каждого из участников воспаления выделить трудно.

Анализ ХМС по Осипову - это метод анализа микробиоты, разработанный российским учёным Георгием Андреевичем Осиповым. Основан на использовании газовой хроматографии и масс-спектрометрии для идентификации микроорганизмов.

В основе метода лежит определение маркеров микроорганизмов, индивидуальных для каждого представителя микромира. По этому набору можно судить о составе микробиоты. Метод позволяет получить точный результат за короткое время по сравнению с классическим микробиологическим исследованием.

Принцип метода: из образца биологического материала выделяется липидная фракция. Затем с помощью газового хроматографа сложная смесь микробных маркеров разделяется на индивидуальные компоненты, которые далее поступают в масс-спектрометр. Масс-спектрометр действует как сверхточный детектор, идентифицируя каждое вещество по массе и заряду иона. Сравнивая полученные спектры с обширной библиотекой эталонных спектров NIST, компьютерная программа выдает точный качественный и количественный состав присутствующей микробиоты.

Преимуществами метода являются:

• Широкий диагностический спектр микроорганизмов.
• Универсальность - позволяет выявлять разные группы микроорганизмов: бактерии, грибы, вирусы, в том числе анаэробные, которые часто являются причиной воспалительных процессов.
• Высокая чувствительность -  позволяет определять малые количества веществ микробного происхождения.
• Отсутствие необходимости в культивировании микроорганизмов и использовании биохимических тестовых материалов.

Данное исследование позволяет:

• определить качественный и количественный состав биотопа урогенитального тракта;
• определить причину инфекционно-воспалительного процесса.

Исследование не включено в Клинические рекомендации и протоколы МЗ РФ. Рекомендуется применять в качестве вспомогательного/дополнительного метода диагностики.

Показания к исследованию:

• Хронические воспалительные заболевания урогенитального тракта;
• Боли при мочеиспускании, выделения из влагалища;
• Нарушение микробиоты урогенитального тракта на фоне приёма антибиотиков;
• Дифференциальная диагностика инфекций урогениальной системы;
• Контроль эффективности лечения мочеполовых инфекций;
• Подозрение на дисбиоз урогенитального тракта.

В сопровождающем результат отчете представлены концентрации выявленных микроорганизмов в сопоставлении с референсными значениями для понимания  их избытка или дефицита. Дополнительно показаны удобные таблицы сгруппированных микроорганизмов.