Исследование микробиоты (биотоп "Цервикальный канал") (ГХ-МС по Осипову)

Метод исследования: ГХ-МС.

Микробиом человеческого кишечника представляет собой уникальную совокупность микроорганизмов. Его незримое присутствие регулирует целый ряд важных процессов - от метаболических и иммунных до когнитивных, а отклонение его состава от нормы приводит к развитию разнообразных патологических состояний: желудочно-кишечных, аллергических и аутоиммунных заболеваний, сахарного диабета, ожирения и т.п.

В настоящее время понятие «микрофлора человека» утратило свою актуальность: мы несем в своем организме не просто набор бактерий, а настоящий биом - микробиом. Наше тело - это место обитания многочисленной популяции микроорганизмов, своего рода микробная экосистема, характеризующаяся своей генетической регуляцией и сложными взаимодействиями и реагирующая на влияние факторов внешней и внутренней среды. Она настолько уникальна, что в мире не найдется двух людей с идентичным микробиомом.

Микробиом распределен в нашем организме неравномерно, по его топографии и видовому составу принято различать микробиом кожи, полости рта, дыхательных путей, урогенитального тракта и кишечника.

Цервикальный канал представляет собой канал шейки матки, который соединяет влагалище с полостью матки.

Основным компонентом микрофлоры цервикального канала являются лактобактерии. В процессе своей жизнедеятельности они вырабатывают молочную кислоту, тем самым поддерживают определенный уровень pH (кислотность) во влагалище и канале шейки матки и препятствуют размножению патогенной флоры. Также выявляют стафилококки, бактероиды и некоторые другие виды бактерий и грибов.

Среди микроорганизмов, часто обнаруживаемых при воспалительном процессе (цервиците), встречаются на первом месте по частоте выявления Enterococcus spp., а точнее – Е. faecalis, на втором месте - микроорганизмы, принадлежащие семейству Enterobacteriaceae spp. , среди его представителей наиболее часто в посевах наблюдался рост Escherichia coli, Также значимыми являются Gardnerella vaginalis, Corinobacteria spp., Proteus spp.,Acinetobacter Staphylococcus spp., встречаются коринобактерии и клостридии.

Анализ ХМС по Осипову - это метод анализа микробиоты, разработанный российским учёным Георгием Андреевичем Осиповым. Основан на использовании газовой хроматографии и масс-спектрометрии для идентификации микроорганизмов.

В основе метода лежит определение маркеров микроорганизмов, индивидуальных для каждого представителя микромира. По этому набору можно судить о составе микробиоты. Метод позволяет получить точный результат за короткое время по сравнению с классическим микробиологическим исследованием.

Принцип метода: из образца биологического материала выделяется липидная фракция. Затем с помощью газового хроматографа сложная смесь микробных маркеров разделяется на индивидуальные компоненты, которые далее поступают в масс-спектрометр. Масс-спектрометр действует как сверхточный детектор, идентифицируя каждое вещество по массе и заряду иона. Сравнивая полученные спектры с обширной библиотекой эталонных спектров NIST, компьютерная программа выдает точный качественный и количественный состав присутствующей микробиоты.

Преимуществами метода являются:

• Широкий диагностический спектр микроорганизмов;
• Универсальность - позволяет выявлять разные группы микроорганизмов: бактерии, грибы, вирусы, в том числе анаэробные, которые часто являются причиной воспалительных процессов.
• Высокая чувствительность -  позволяет определять малые количества веществ микробного происхождения.
• Отсутствие необходимости в культивировании микроорганизмов и использовании биохимических тестовых материалов.

Данное исследование позволяет:

• определить качественный и количественный состав биотопа урогенитального тракта;
• определить причину инфекционно-воспалительного процесса.

Исследование не включено в Клинические рекомендации и протоколы МЗ РФ. Рекомендуется применять в качестве вспомогательного/дополнительного метода диагностики.

Показания к исследованию:

• Хронические воспалительные заболевания урогенитального тракта;
• Боли при мочеиспускании, выделения из влагалища;
• Нарушение микробиоты урогенитального тракта на фоне приёма антибиотиков;
• Дифференциальная диагностика инфекций урогениальной системы;
• Контроль эффективности лечения мочеполовых инфекций;
• Подозрение на дисбиоз урогенитального тракта.

В сопровождающем результат отчете представлены концентрации выявленных микроорганихмов в сопоставлении с референсными значениями для понимания  их избытка или дефицита. Дополнительно показаны удобные таблицы сгруппированных микроорганизмов.